《拉貝日記》取材自拉貝撰寫的戰時日記《拉貝日記》，通過這個“中國版辛德勒”的傳奇故事，再現了南京那段驚心動魄的慘烈記憶。影片從親歷者角度記錄了“南京大屠殺”始末，是證實“南京”事件信息最為完整詳實的史料。曾經對納粹主義深信不疑的拉貝，在戰爭的殘酷現實中挺身而出，在“南京大屠殺”期間一手組建起“國際安全區”，挽救了20萬中國百姓的生命。然而拉貝回德國后，長期經歷排查，晚年黯然病逝于柏林，《拉貝日記》也成為一段塵封記憶。　　1937年，距今差不多30年前，商人拉貝和他的妻子DORA生活在中國當時的首都—南京，他是西門子分部的負責人。他很難割舍把這個分部移交給他的繼承人WERNER FLIESS。他愛中國，他知道在這里他是個有號召力的人物，然而回到柏林西門子總部，他只是眾雇員中的一名而已。在他的慶功歡送舞會上，日軍轟炸了南京城，隨后日軍攻占了上海。由于恐慌事件突發，拉貝毅然打開公司的大門為他的中國員工及其家庭提供避難。　　第二天清早，當戰火熄滅，清查損失時，呆在南京城的外國人們開始商議在如此危險的時刻他們應該如何是好。德國猶太人外交官GEORG ROSEN告訴他們說上海有一個可以保障老百姓的安全區。VAL RIE DUPR S——金陵女子學校的老師立刻覺得這個想法很好，并提名拉貝為主席。作為一個德國人，他或多或少可以被看做是日本人的“同盟”。她的建議讓當地醫院的內科醫生ROBERT WILSON醫生感到十分惱怒，因為他痛恨“納粹黨員”。事實上，拉貝本想第二天就離開南京返回德國；但此刻他決定要留下來，并且即刻認真地投入工作。　　當日本帝國主義的軍隊在中國人民身上殘忍發泄并施以暴行的時候，拉貝和他的同伴們機智勇敢地與日軍周旋，艱難地為南京老百姓提供安全區的保障。數十萬的老百姓涌入安全區——這比想象中的多的多。但是，日軍仍舊在虐殺和殘害中國的老百姓，安全區的補給越來越艱難。 隨后，日軍計劃以一個假像來摧毀安全區——拉貝開始了與時間的賽跑……