幾代神龜大集合，這最後的輝煌一閃，只有陪它一路走來的人才懂得。在月光下，在黑夜中，在大都會的樓宇間，瀟灑的身影穿梭出沒於鋼筋水泥的叢林，跳轉騰挪的颯爽英姿動人無比！不是蜘蛛俠又織起了法網，不是蝙蝠俠又展開了雙翼，也不是氪星超人又重出江湖，半真半幻的跳躍腳步，來自以保衛地球打擊罪惡為己任的忍者神龜。慣使武士刀的“藍霹靂”達·芬奇、手持木棒的“愛因斯坦”多納凱羅、暗藏忍者匕首的“火爆紅”拉斐爾和雙節棍舞得虎虎有聲的“掉鍊子”米開朗琪羅，利落身手和聰明頭腦比任何超級英雄都毫不遜色的小龜們，個個都是個性十足、忍者功夫精到的全能高手。它們的敵手當然也壓根不示弱。耍著三叉、斧、矛、劍的精英忍者、五大元素魔法忍者，隱形忍者和紐約大腳忍者幫派，在章子怡配音的凱利的領導下，就已經夠難應付的了。而3000年一劫的遠古魔獸軍團，更是個個邪惡無比，更別提幕後還有高科技鉅子黑手掌控、翻天覆地！看來即便是內外兼修、膽大包天的綠皮英雄們，這次也免不了吃點苦頭咯！