第一夜：被全球通緝的危險黑客組織“Phantom20”突然對日本金融界的中樞機構光明銀行進行網絡攻擊！光明銀行副行長宇田川（中尾彬 飾）一籌莫展之際，警方在警視廳刑事部長浪越謙次朗（香川照之 飾）的指揮下，在搜查總部秘密采取應急措施，卻依然對罪犯束手無策……。但是，一名男子拯救了這一前所未有的危機。他就是明智小五郎（西島秀俊 飾）——一位率領著一支實力超群的黑客技術團隊“TeamBD”，自身也擁有豐富的網絡知識和高超技術的人物！浪越看中了明智小五郎的才華，便派警視廳網絡搜查支援室的主任小林芳雄（伊藤淳史 飾）去聘請他做網絡犯罪搜查方面的顧問。緊接著，浪越就委托明智鎖定某起案件的罪犯。大概在半個月之前，有人將包括原未成年犯現住址在內的絕密資料發布到了網上！浪越擔心原未成年犯遭到二次傷害，一心只想盡快將罪犯抓捕歸案。明智立刻破解了問題網站上出現的暗號，成功接觸到自稱SHADOW的罪犯。與此同時，SHADOW針對真正的目標展開行動。SHADOW宣布要對最初的目標進行制裁，并給出難解的暗號作為提示！破解暗號的期限為60分鐘。面對SHADOW下的戰書，明智面露無所畏懼的微笑正面應戰。但是……！？