高斯奧特曼VS傑斯提斯奧特曼一天，宇宙開發中心的上空發現了來歷不明的太空船，一名神秘女子出現，中心繼而受到兩隻怪獸的襲擊。超人高斯及時出現，但怪獸極之頑強，高斯幾乎不敵，幸得春野武藏之助，二人融為一體後始威力大增，而正當怪獸快被擊退之際，另一個超人迪斯忽然出現，她竟然出手阻止高斯保護地球，最後竟令高斯及武藏死於怪獸之手。太空船的目的到底是什麽？
原來，神秘女子來地球竟是為了維持宇宙的秩序，而要把地球上所有生物全部消滅！為了自救，地球各國各盡辦法，但似乎，高斯的死已是提前判了死刑。地球即將毀於一旦，大家了無辦法，除非奇蹟出現…然而，武藏的親人和隊友都堅信高斯和武藏未死，他們四出奔走，希望奇蹟真的出現！
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