蓋亞奧特曼1997年，超級電腦煉金之星預測到地球將會破壞招來體所消滅。得知此事后人類用煉金之星的研究技術組成一個全球防御組織GUARD，而XIG則是GUARD的戰斗力量。　　2000年，天才少年·高山我夢在一次試驗中見到神秘的紅色光之巨人。當破壞招來體第一次進攻的時侯，XIG起不到作用。此時，我夢墜入光之隧道，并再次看見巨人，他希望巨人能賜予力量保衛地球。于是，巨人與我夢合二為一，并與破壞招來體展開了戰斗。　　在戰勝破壞招來體之后，我夢加入了XIG，而巨人則被命名為“蓋亞”。但此時，另一名青年·藤宮博也亦擁有著變身成巨人“阿古茹”的力量。兩個巨人與破壞招來體將會展開一連串的戰斗。