《暗殺教室》當中，被稱為史上最兇惡存在的“殺老師”將月球炸掉了七成，並且宣稱將會把目標瞄準地球。可是這樣一個恐怖的存在卻不知為何擔任著椚丘中學3年E班的教師。因此，全世界各國的首腦們都將清除這一威脅的使命委託給了這個班的學生們，希望能夠在一年之內乾掉殺老師... 《暗殺教室》當中，被稱為史上最兇惡存在的“殺老師”將月球炸掉了七成，並且宣稱將會把目標瞄準地球。可是這樣一個恐怖的存在卻不知為何擔任著椚丘中學3年E班的教師。因此，全世界各國的首腦們都將清除這一威脅的使命委託給了這個班的學生們，希望能夠在一年之內乾掉殺老師，而一旦任務成功，學生們就能獲得一百億日元的驚人報酬（後來改為個人一百億日元、團體三百億日元）。因此，大家絞盡腦汁地想辦法幹掉殺老師，而這部校園+詭異+搞笑的故事也就此展開。